دسته بندی فیلوژنتیکی جدایههای اشریشیاکلی بهدست آمده از موارد عفونت ادراری شهرستان بجنورد به روش جدید گروهبندی کلرمونت
نویسندگان
1 استادیار، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرمسازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، شعبه مشهد، مشهد، ایران
2 استادیار، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرمسازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، شعبه مشهد، مشهد، ایران
3 استادیار، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرمسازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، شعبه مشهد، مشهد، ایران
4 دانشآموخته کارشناسی ارشد رشته باکتریشناسی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران
5 استادیار، گروه مهندسی کامپیوتر، دانشگاه بینالمللی امام رضا (ع)، مشهد، ایران
doi
10.22034/nfvm.2022.333317.1132چکیده
عفونتهای ادراری (UTI) یکی بارزترین عفونتها در بیماران مراجعه کننده به بیمارستان و همچنین اشریشیاکلی شایعترین پاتوژن و همچنین مسئول 85-50 درصد عفونتهای ادراری در جوامع و بیمارستانها است. نوترکیبیها، در جمعیت باکتری اشریشیاکلی منجر به تنوع در میان آنها و شکلگیری گروههای فیلوژنتیک میگردد. با تعیین هویت اجدادی سویهها و گروهی که باکتری به آن تعلق دارد، میتوان به ماهیت بیماریزا یا فلور طبیعی یا پاتوژن بودن باکتری پی برد. در این مطالعه در بازهی زمانی 4 ماهه تعداد 50 نمونه از کشتهای مثبت دارای عفونت ادراری ارجاع شده به آزمایشگاه مستقر در بیمارستان ثامنالائمه شهرستان بجنورد مورد بررسی قرار گرفت. پلیتهای دارای باکتری که در محیط کشت مککانکی آگار دارای کلنیهای صورتی رنگ بودند بهعنوان جدایههای مشکوک به اشریشیاکلی انتخاب شدند و بهوسیله آزمایشهای بیوشیمیایی (IMVIC) تأیید جدایهها صورت پذیرفت. در این مطالعه از روش PCR و پرایمرهای طراحی شده از چهار ژن yjaA،chuA ،arpA و TspE4.C2 جهت تعیین گروههای فیلوژنتیکیC ،F ،E ،B2 ،B1 ،A و D استفاده گردید. در این مطالعه میزان فراوانی گروههای فیلوژنتیکی به ترتیب B2 (24 درصد)، F (22 درصد)، B1 (18 درصد)،D (16 درصد)،A (8 درصد)، C (6 درصد) و E (6 درصد) مشاهده گردید. تمامی جدایههای مورد مطالعه با کمک روش جدید دستهبندی فیلوژنتیکی کلرمونت قابل دستهبندی بودند. در میان جدایههای مورد مطالعه طیف گوناگونی از گروههای فیلوژنتیکی مشاهده گردید.